TOP500 の NEWS 欄には、毎週スーパーコンピューターに関する最新情報が報告されています。残念ながら、日本のメディアではほとんど報道されません。当ウェブサイトでは、それらのニュースを定期的に日本語で紹介していきま
Read moreカテゴリー: 一般的な話題
双性イオン中間体が鍵!有機触媒を用いた [6+4] 環化付加反応
あけましておめでとうございます。 昨年 11 月、12 月は、多忙のため記事の更新ができませんでしたが、今年はもっと更新していきたいと思います。 さて、もう 4 ヶ月も前になってしまいますが、シンコナアルカロイド有機触媒
Read moreDirected Evolution と De novo 酵素デザインを組合わせた研究例
少し時間が経ってしまいましたが、今月初旬にノーベル賞が発表されましたね。 2018 年のノーベル化学賞はファージディスプレイ (Phage Display) と指向性進化法 (Directed Evolution) に授
Read moreホフマンがやって来る!
福井謙一生誕百年記念事業のメモリアルシンポジウム(10月12日、京都)にロアルド・ホフマン(Roald Hoffmann) がやってくるそうです。 化学をやっている人にとっては、ウッドワード・ホフマン則でもお馴染みの方で
Read moreもしも計算化学プログラム自体にミスがあったら、、、
計算化学者は、Developper と User の大きく二つのグループに分けられると思います。 計算化学 User の人には、実験化学者の人も多く、計算化学ソフトウェアをブラックボックス的な感じで使っている人も多く、具
Read moreイオン液体の DMSO 中での酸性度の計算
有機化学反応機構を考察する上で、pKa の値を知っておくことは非常に重要です。Evans や Bordwell などの pKa テーブルを使用している方も多いのではないでしょうか? しかし、pKa テーブルには載っていな
Read moreOverleaf で論文作成!
昨年、ある雑誌に論文を投稿しようとしましたら、Word での template が存在せず LaTeX ファイルの template しかありませんでした。。。 新しく創刊された Open access の雑誌などで特に
Read moreAutoDock のスコアファンクションはどれくらい正確か?CASF-2013 ベンチマーク
創薬研究において、低分子医薬品のタンパク質への結合様式の情報は非常に重要です。 共結晶の取得が望ましいですが、結晶化が困難な場合も多いです。 そのような場合に、威力を発揮するのがドッキングシミュレーションです。 様々なド
Read more計算化学を用いた天然物の構造訂正
多種多様な構造で我々を魅了してくれる天然物化合物。医薬品シードとしても有用なこれらの有機化合物の単離構造決定は世界中で盛んに行われています。 しかし、その構造の複雑さ・特殊さから構造を決めることが困難な場合も多数あります
Read moreP450 の量子化学計算【Griseofulvin】
酸化酵素の中でも P450 は、多彩な反応を触媒するため多くの研究者の注目を集めています。P450 を用いたエンジニアリングも盛んに行われており、最近ではカルベノイドやナイトレノイドを発生することのできる P450 も報
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