遷移状態のCBS-QB3計算ができません
光化学反応を研究している大学院生です.Gaussian16で遷移状態の高精度エネルギー計算を行おうと思っているのですが,うまくいきません.
DFT b3LYP 6-31++G(d,p)を用い,QST2法で反応物と生成物から遷移状態の構造を計算しました.その構造を用いて,CBS-QB3法でエネルギー計算を行いました.すると,遷移状態の構造が構造最適化されてしまい,生成物の構造が出力されました.また,エネルギーも生成物のものが出力されてしまいました.もちろんキーワードとしてoptを入れているわけではありません.
構造最適化を済ませたchkファイルを読み込ませれば良いとの情報を得て試したのですが,同様の結果になりました.
遷移状態構造のCBS-QB3法によるエネルギー一点計算はどのように行うのでしょうか?ある論文では,遷移状態のエネルギーもCBS-QB3法によって求めており,原理的には不可能ではないと思っています.
また,そもそもエネルギー計算しかできない計算方法なのに,なぜインプットした構造が変わるのか疑問に思いました.
お忙しいところ恐れ入りますが,ご存知でしたらご教示お願い致します.
最後になりましたが,このようなサイトを作っていただき,大変感謝しております.いつも参考にさせていただいています.
そのキーワードだけだと chk ファイルの読み込みが出来ていないと思います。
freq=readfc とか guess=read とか geom=check とか chk ファイルを読み込むキーワードを色々調べてみて下さい。
あと、キーワードセクションと電荷・多重度の間にタイトルセクションを入れて下さい。
参考として貼って頂いた blog をみますと、”If you want to obtain a G3 energy of a transition state, or a minimum calculated using any basis set other than 6-31G(d), you will need to start the G3 job from a checkpoint file from a frequency calculation containing a geometry and force constant matrix (Hessian) computed previously at your preferred level of theory.” と書いてあります。
一応確認ですが、今回使用している chk ファイルは、qst2 計算の後に freq 計算した時の chk ファイルですか?
また、geom=connectivity は不要だと思います。(ONIOM などで MM を使う場合は、geom=connectivity を使った方が良いそうですが。。。)chk ファイルから座標を読み込むときは、geom=check を使い、座標情報を input に書く必要はありません。参考に貼って頂いた blog では geom=allcheck を使用しています。これだと、座標以外にも電荷、多重度、タイトルセクションなども読み込まれるため、input ファイルをさらに省略することができます。
ご参考になれば幸いです。