計算化学.comスタッフのkwh_rd100 です。各種の計算ソフト群をツールと割り切って使う立場から、2021年10月前半の注目論文 BEST3 を紹介させて頂きます。 1)DTi2Vec: Drug–target i
どちらの経路が有利か？
ある分子から二つの経路が可能な場合、『どちらの経路が有利か？』ということで頭を悩ます人も多いかと思います。
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分子を回転させよう！
計算化学で得られた三次元構造を学会発表等で使う方も多いとおもいます。 しかし、普段からGauss Viewなどで三次元構造を見慣れている人でないと、どのような分子かを認識することは難しいです。三次元構造の横に、二次元の構
Read moreSupporting Informationの座標作成
計算化学の結果を論文にする時、Supporting Information（以下SI）に座標情報を載せる必要があります。 SIの書式はGaussianのinputファイルやlogファイルとは異なっており、体裁を整える必要
Read moreMøller-Plesset法
メラー＝プリセット法（Møller-Plesset method） ハートリーフォック法（HF法）では、電子相関の見積もりに問題があった。 Rayleigh-Schrodingerの多体摂動論では、ハミルトニアンを0次と
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terminalの背景
計算化学をやっている人ならば、GUIを使わずにterminalなどで作業する人が多いと思います。そのとき、terminalの背景は何色にしていますか？
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計算化学をこれから始める上で知っておいた方が良いパソコンの知識
近年、パソコンの機能向上とともにソフトウェアの開発も進み、専門家以外でも簡単に計算化学を利用することが可能な環境が整って来ました。 例えば、昔の Gaussian は昔はコマンドライン画面で操作するしかありませんでしたが
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M06 / M06-2X
Donald G. Truhlar らにより発表された混成メタ GGA 汎関数（参考文献 1）。PBE 交換汎関数を運動エネルギー密度項で補正した M05 交換汎関数と B97 相関汎関数を、メタ GGA 汎関数の VS
Read moreNBO解析のinputファイル作成方法
NBO 解析の input ファイル作成方法を解説します。
Read moreGaussian の logファイルの読み方【Gaussian】
本記事では、初心者の人向けに gaussian の log ファイルの読み方を解説します。 まず、計算が終了したら log ファイルを text editor で開いて下さい。terminal が使える方は、vi で開い
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