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  • YouTube動画で、計算化学について学んでみました

    こんにちは。田中です。 私は、計算化学やシミュレーションに関しては、全くの初心者(素人)です。そんな私が、これから計算化学を学んでいくわけですが、「素人が計算化学を学んで、何をどう理解していくのか?(そもそも、理解できる

  • インターネット記事で、計算化学について学んでみました

    こんにちは。田中です。 私は、計算化学やシミュレーションに関しては、全くの初心者(素人)です。そんな私が、これから計算化学を学んでいくわけですが、「素人が計算化学を学んで、何をどう理解していくのか?(そもそも、理解できる

  • ログイン機能を実装する。電子実験ノートを自作してみた!導入コストゼロ!(5/5)

    前回に引き続き、電子実験ノートの自作の記事です。 今回は、電子実験ノートにログイン機能を実装します。 特に、研究グループ全体で電子実験ノートをシェアする場合など、ログイン機能や権限の付与は非常に重要となってきます。 また

  • PHP でブラウザから job を投入する。電子実験ノートを自作してみた!導入コストゼロ!(4/5)

    前回に引き続き、電子実験ノートの自作の記事です。 今回は、電子実験ノートから計算機に job を投入し、同時にノートを作成する機能を実装していきます。 参考:電子実験ノートを自作してみた!導入コストゼロ!(1/5)参考:

  • CRUD を実装!電子実験ノートを自作してみた!導入コストゼロ!(3/5)

    前回の記事に続き、電子実験ノートの自作の記事です。 今回は、記述、閲覧、編集、削除などの、実験ノートに必要な基本的な機能を実装していきます。 これらの機能は Create, Read, Update, Delete の頭

  • リアルタイムで計算状況を表示するシステムの構築!【電子実験ノートを自作してみた!導入コストゼロ!】(2/5)

    本記事は、前回の記事(電子実験ノートを自作してみた!導入コストゼロ!(1/5))の続きになります。 今回は、リアルタイムで複数の計算機での job の実行状況を表示させるシステムの構築を行います。 初心者の方でも、PHP

  • 電子実験ノートを自作してみた!導入コストゼロ!(1/5)

    管理人の大学院時代は、実験ノートは紙が当たり前でしたが、最近では電子実験ノート(Electronic Lab Notebook; ELN) がだいぶ普及しているようです。 電子実験ノートには様々なメリットがあります。例え

  • 分枝型拡張ヘテロ開裂反応の理論解析!〜divergent extended heterolytic fragmentations〜

    開裂反応というと、Eshenmoser 開裂や Mehta 開裂や Risch 開裂などが挙げられます(下図)。 このような結合の開裂を伴う fragmentation 反応は、分子骨格を構築する際の鍵反応として、全合成

  • 読み取りにくい SI の座標を簡単表示【python で OCR】

    SI の書き方は、研究室によって様々です。 丁寧に計算座標を何ページにも渡って貼り付けてくれる人もいれば、計算の input ファイルと output ファイルを supplementary material にしてくれ

  • Gauss View をカスタマイズしよう!その2【NMR の referenceを追加】

    計算化学が非常に身近になった現在では、実験化学者も簡単なスペクトル計算を活用して研究を進めているのではないでしょうか? 例えば、NMR 計算は、計算コストが小さく、もっとも手軽な計算の一つです。 参考:NMR計算のアドバ

計算化学ポータルサイト

アクセル・ベッケ Axel D. Becke

2016年11月8日 管理人 計算化学者

Axel Dieter Becke (1953 年 6 月 10 日 -) 理論化学者。カナダのダルハウジー  Dalhousie 大学教授。 (トップ画像は youtube より転載)

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PBE0 混成汎関数

2016年11月8日 管理人 汎関数, 計算手法

PBE 交換・相関汎関数を拡張することを目的とした混成汎関数である。

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【河波保雄】はじめての量子化学計算―基礎と可視化 (I・O BOOKS)

2016年11月7日 管理人 書籍

Excel を用いて量子化学計算を行う方法を解説している書籍です。

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Rh の C-H 挿入反応の新知見〜遷移状態後の枝分かれ〜

2016年11月1日 管理人 ブログ, 一般的な話題

一般に化学反応において副生成物が得られる場合、主生成物が得られる経路とは別の反応経路により生成すると考えます。すなわち、共通の原料から異なる遷移状態を経てそれぞれの生成物へと枝分かれしていくと。。。 しかし、共通の遷移状

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密度汎関数法の基礎 (KS物理専門書)

2016年10月27日 管理人 書籍

(トップ画像は、KS物理専門書公式ページより転載) 量子化学の基礎理論や Gaussian の使い方について書かれた本は多く存在しますが、あまりにも基礎的すぎたり、または実践的すぎたりすることがあります。そのため、DFT

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すぐできる量子化学計算ビギナーズマニュアル (KS化学専門書)

2016年10月23日 管理人 書籍

(トップ画像は、出版社の公式サイトより) 計算化学の入門書としてどの参考書を選んだら良いのか悩む人は多いと思います。特に、量子化学計算の参考書は数式が多いため、簡単な入門書を求める人が多いです。「すぐできる量子化学計算ビ

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gfortran のライブラリが見つからない。[Amber]

2016年9月9日 管理人 ブログ, プログラミング, 一般的な話題

以前、Amber Tool16 のインストールに際し、 ./configure -noX11 gnu を実行したところ 1. gcc のバージョンが対応していない 2. library not found for -lg

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mPW1PW91

2015年10月22日 管理人 汎関数

1998年にCarlo AdamoとVincenzo Barneにより開発された混成(hybrid)汎関数である(文献 1)。

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M06 / M06-2X

2015年10月13日 管理人 汎関数, 計算手法

Donald G. Truhlar らにより発表された混成メタ GGA 汎関数(参考文献 1)。PBE 交換汎関数を運動エネルギー密度項で補正した M05 交換汎関数と B97 相関汎関数を、メタ GGA 汎関数の VS

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お問い合わせ webmaster [at] computational-chemistry.com twitter @ComputerChemもっとも読まれている記事 1. 虚振動とは?遷移状態とは? 2. IRC 計算がうまくいかない時にため試すこと 3. 汎関数の選び方【DFT 計算】 4. 協奏的?それとも段階的? 5. JACS の Editor Reject を一単語で表現する 6. 基底関数の選び方 7. 1,2-ヒドリドシフトと 1,2-プロトンシフトはどちらが正しいのか?









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