プログラミング | 計算化学ポータルサイト

Webスクレイピングで文献検索を効率化！第1回【Python】

Share This: 最近、記事の更新がめっきり遅くなってしまいました。 4, 5 月は、Review を書いたり、普通の投稿論文を書いたり、申請書の締め切りがあったりで全く時間が取れませんでした。特に、Review

Share This: Gaussian で NBO 計算し、軌道を表示しようとすると、log ファイルの軌道番号と Gauss View 上の番号が一致しないという思わぬトラブルに遭遇します。今回の記事では、NBO

Share This: 遷移状態構造の探索などを行う際に gaussian の modredundant の scan コマンドを使うことが多いと多います。通常は、log ファイルを gauss view で開いてエネ

Share This: Gaussian で ONIOM 法により計算を行う際に Tao Package を利用して input ファイルを作ると非常に楽です。 Tao Package は非常に便利なプログラムなのですが

Share This: GRRM による量子化学計算の log ファイルは、そのままでは Gauss View で開くことができません。構造最適化なら log ファイル末尾の座標情報を切り出してきて、input ファイル

Share This: スーパーコンピューターの計算速度の世界ランキング「ＴＯＰ５００」が発表されました。一位は、中国の神威太湖之光。日本は 6 位に「オークフォレスト・パックス」、7 位に「京」が入りました。引用元

Share This: Gaussian での計算結果の log ファイルを見るとエネルギーは全て a.u. という単位で書かれています。論文等で使われる eV や kcal/mol 、kJ /mol を用いない理由は何

Share This: 計算化学にプログラミングは必須ではありませんが、プログラミングを知っていると解析スピードが 100 倍くらい速くなります。しかし、大学で化学しか勉強してこなかった人にとってプログラミングは未知の

Share This: 計算化学の論文では、SI の座標情報を読み取りづらくしている場合が多く見受けられます。計算化学は、座標情報さえあれば簡単に論文を出せてしまうため仕方のない対策のように思われますが、先行研究を参考

Share This: 以前、Amber Tool16 のインストールに際し、 ./configure -noX11 gnu を実行したところ 1. gcc のバージョンが対応していない 2. library not f

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