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投稿者: 管理人

【Threadripper】16コア Whitehaven に期待!【Ryzen9_AMD】

2017年5月12日 管理人 ニュース, ブログ

計算化学をやっている人なら、少しでも早く研究を進めるために性能の良い計算資源をより多く確保したいと思うかと思います。 特に論文の再投稿期限が迫っていて ”この 1 job に全てをかけるぜ!” みたいな時には高クロックの

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リーナス・テック・ティップス Linus Tech Tips

2017年5月7日 管理人 コンピューター関係の人物, 一般的な話題

リーナス・テック・ティップス Linus Tech Tips とは、カナダ人のリーナス・セバスティアン Linus Gabriel Sebastian (born August 20, 1986-) が公開している yo

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【Gaussian09】隠しコード?【Morokuma-energy-decomposition】

2017年5月2日 管理人 一般的な話題

今年初めに Gaussian 16 が発売されたのに伴い、Gaussian 社の HP が一新されました。 IOp の Reference も全て g16 対応のものとなってしまい、g09 用の IOp マニュアルは消え

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【Gaussian 16】デスクトップ PC で並列計算する際の注意点【Hyperthreading】

2017年4月28日 管理人 一般的な話題

最近のデスクトップ用 CPU は大変高性能になっており、intel の core i7 7700k は4.2 GHz (4.5 GHz) で4 core/8 thread、AMD の Ryzen 1800x は 3.6

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ドッキングシミュレーションのやり方【AutoDock vina】

2017年4月26日 管理人 計算テクニック

AutoDock は、タンパク質にリガンドをドッキングするドッキングシミュレーションに広く用いられています。他にもドッキングシミュレーション用のソフトはいくつもありますが、一番の特徴は無料であるということだと思います。

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Gaussian 16 vs 09 ベンチマーク

2017年4月20日 管理人 一般的な話題

今年発売された Gaussian 16 ! 新機能も気になるところですが、既存の Gaussian 09 とどれほどの差があるのかという点も気になります。 今回は、構造最適化、遷移状態構造の最適化、振動計算について2つを

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gaussian 16 Rev. A.03 は pascal 世代の GPU に未対応?

2017年4月19日 管理人 一般的な話題

先日、nVIDIA の GTX 1080 Ti を自作パソコンに入れました。 これからは GPGPU をフル活用していこうと思っており、これまで作ったプログラムを cuda 仕様に書き換えている今日この頃です。 さて、今

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nVIDIA で画面真っ暗【Linux】

2017年4月13日 管理人 一般的な話題

先日の記事で、Fedora 25 に無事 nVIDIA ドライバーと CUDA ToolKit 8.0 をインストールできたと書きました。しかし、その後いろいろと不具合があったため Fedora 23 へとヴァージョンを

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Gaussian のスクラッチファイル

2017年4月7日 管理人 ブログ, 一般的な話題

Gaussian での計算中には、複数のスクラッチファイルが生成します。しかし、それぞれのファイルがどのような役割なのか、どうやって削除・保存するのかを知っている人はほとんどいないと思います。 そこで、本記事ではスクラッ

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Gaussian 16 を自作 PC で動かしてみた!

2017年4月6日 管理人 一般的な話題

先日の記事で自作 PC で Gauss View 6 を動かしてみました。 今回は、Gaussian 16 を自作 PC で動かしてみた時の様子について述べさせていただきたいと思います。g16 と g09 についても振動

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