計算化学者は、Developper と User の大きく二つのグループに分けられると思います。 計算化学 User の人には、実験化学者の人も多く、計算化学ソフトウェアをブラックボックス的な感じで使っている人も多く、具
Read more投稿者: 管理人
イオン液体の DMSO 中での酸性度の計算
有機化学反応機構を考察する上で、pKa の値を知っておくことは非常に重要です。Evans や Bordwell などの pKa テーブルを使用している方も多いのではないでしょうか? しかし、pKa テーブルには載っていな
Read moreOverleaf で論文作成!
昨年、ある雑誌に論文を投稿しようとしましたら、Word での template が存在せず LaTeX ファイルの template しかありませんでした。。。 新しく創刊された Open access の雑誌などで特に
Read moreAutoDock のスコアファンクションはどれくらい正確か?CASF-2013 ベンチマーク
創薬研究において、低分子医薬品のタンパク質への結合様式の情報は非常に重要です。 共結晶の取得が望ましいですが、結晶化が困難な場合も多いです。 そのような場合に、威力を発揮するのがドッキングシミュレーションです。 様々なド
Read more32 コア Threadripper2、2018 年夏に発売予定【AMD】
AMD から Threadripper 2 が発表されました。現在のところ 8 月 13 日に市場に投入予定と言われています。 驚くべきは、そのコア数! 32-core/64-thread の Ryzen Threadr
Read moreTop500 で大きな順位変動!日本は 5 位。Green 500 は上位独占、HPCG は 3 位後退。【2018年6月】
2018 年 6 月のスパコンランキング TOP500 と GREEN500 が発表されました。スパコンの単純な計算性能を競う TOP500 では、今回大きな順位変動が起きました。アメリカのスパコンが新たに1位と3位にラ
Read more計算化学を用いた天然物の構造訂正
多種多様な構造で我々を魅了してくれる天然物化合物。医薬品シードとしても有用なこれらの有機化合物の単離構造決定は世界中で盛んに行われています。 しかし、その構造の複雑さ・特殊さから構造を決めることが困難な場合も多数あります
Read moreCavium 社が ThunderX2 ARM プロセッサーをリリース!
Cavium は ThunderX2 プロセッサーを一般向けにリリースしました。ARM 搭載の第 1 世代高性能コンピューターに向けたものと思われます。 TOP500 の NEWS 欄には、毎週スーパーコンピューターに関
Read moreP450 の量子化学計算【Griseofulvin】
酸化酵素の中でも P450 は、多彩な反応を触媒するため多くの研究者の注目を集めています。P450 を用いたエンジニアリングも盛んに行われており、最近ではカルベノイドやナイトレノイドを発生することのできる P450 も報
Read more不正を犯した研究者のためのリハビリプログラム
昨年、論文不正で非常に話題になった東京大学の渡邊嘉典元教授が、イギリスのクリック研究所で不正研究者のためのリハビリプログラムに参加し、復帰を目指しているようです。 Nature News に出ていましたので、簡単に意訳し
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