gaussian | 計算化学ポータルサイト

Cope 転移を触媒する酵素【hapalindole 生合成】

今年の初め頃、David Sherman と Kendal Houk らのグループから hapalindole 生合成での Cope 転移を触媒する酵素 HpiC1 の計算化学も含めた酵素解析の論文が発表されま

励起状態でのプロトン移動（ESPT: Excited-State Proton Transfer ）は蛍光プローブや分子スイッチ、発光ダイオードなどの分子に関係していることから近年注目されている現象です。核酸塩基間でもこ

先月、Gaussian 16 の Revision B.01 がリリースされました。 Gaussian 本社ウェブサイトの Release Note を見ると、Revision B で追加された機能のところに [REV

先日、読者の方から MD 計算を利用したコンフォメーション探索についてお問い合わせがありましたので、まとめてみました。今回紹介する方法は私が考案したものではなく、香川大学の HP に書いてある方法とその補足になります。

様々なベンチマーク論文で良い傾向を示している B97 と $\omega$B97 系汎関数の成り立ちについて本記事では解説しております。gaussian ではB97-1, B97-2, B97-D, $\omega$B

抗腫瘍活性を持つ天然物化合物の calicheammicin や dynemicin にも見られる Enediyne 構造の環化反応である正宗・Bergman 環化の詳細な理論解析の論文が J. Phys. Chem.

先日、Threadripper 1950x での 1 job のみ計算している時と full load 時の計算時間の違いを測定してほしいという要望のメールが読者の方から来ました。メールを下さった方は、1 コアの jo

以前の記事で Threadripper での gaussian16 のベンチマークをお伝えしました。その際、並列化効率が著しく悪いと述べましたが、その後検討を重ねたところ並列化効率が大幅に改善しました。改善後は、 o

前回の記事では、Threadripper の自作 PC を紹介しました。この記事では、実際に Threadripper 上で Gaussian 16 を動かした時の様子を紹介します。今回の記事ではデータ数が少ないですが

これまでも当サイトでは、Rh/Ru を用いた σ-bond activation に適した汎関数！や【Enthalpy】B3LYP での計算誤差について【Underestimation】や Diels-Alder 反応に