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Rosetta を用いた非極性分子の Docking Simulation

Rosetta はワシントン大学の David Baker らの開発したタンパク質モデリングソフトです。人工酵素のデザインや膜タンパクの設計など、ここでは書ききれないほど数々の計算にて活躍してきています（参考文献 1-6

管理人は、2019年5月27〜29日に北海道大学で開催される第22回理論化学討論会に参加します。当サイトの読者の方で参加される方がおりましたら、一緒に食事などいかがですか？26日から現地入りするので、26日の夜でも開催

計算化学を始めたばかりの人と懇親会などでお話しすると、計算機についてよく質問されます。計算化学を専門にやっているってことは、すごい計算機使っているんですか？とか自分はデスクトップで計算しているから計算にすごい時間が

化学系の研究者が目指すトップジャーナルと言えば JACS です。Nature Chemistry の方がインパクトファクターが高かったり、Nature communication の方がプレスリリースがよく出たりしますが

（トップ画像は、こちらのページより転載。）ニューメキシコの Los Alamos National Laboratory に設置されているスーパーコンピューター。スパコンの世界ランキングである TOP500 では、現在

3 月は、いろいろな学会の年会があると思います。出張先で非常に心配になるのが、Wi-fi 環境の有無です。計算化学をやっていれば、少しでも時間が空けばスパコンに接続して計算状況を確認したくなるのが普通だと思います。

テルペノイドは、これまでに 80,000 種以上の化合物が報告されている最大の天然物化合物群です(参考文献 1)。身近なところでは、メントールなどの香料、抗マラリア薬のアルテミシンから抗がん剤のタキソールまで構造・機能共

プメラー転位は、スルフォキシド類から対応する α 置換スルフィド類を合成する反応です。最近、二種の生成物を与えるプメラー型反応での生成物の選択性が計算化学により明らかにされました。以下の文献を簡単に紹介したいと思います

Gaussian で NBO 計算し、軌道を表示しようとすると、log ファイルの軌道番号と Gauss View 上の番号が一致しないという思わぬトラブルに遭遇します。今回の記事では、NBO の可視化方法についてのマ

TOP500 の NEWS 欄には、毎週スーパーコンピューターに関する最新情報が報告されています。残念ながら、日本のメディアではほとんど報道されません。当ウェブサイトでは、それらのニュースを定期的に日本語で紹介していき