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コンフォメーション探索の後処理

計算化学を用いた反応機構解析を行う上で、コンフォメーション探索は非常に重要です。これまでも本サイトではコンフォメーション探索についての記事を公開してきました。 MD 計算を利用したコンフォメーション探索【gromacs】

前回の記事で Ryzen 3900x に Fedora30 を install したことを報告しました。今回の記事では、Ryzen 3900x の Gaussian16 ベンチマークを公開して行きたいと思います。テス

7月7日に発売された Ryzen 3000 シリーズ！シングルスレッド性能マルチスレッド性能ともに対抗の Intel の CPU に勝っている上に、価格は約半額というコスパの良さから発売前から注目を集めていました！管

いつも当ブログの記事をご覧くださり、ありがとうございます。サイト開設から約 4 年が経過し、記事数は節目の 250 記事を超え（今回の記事で 252 記事目です）、twitter のフォロワー数も 800 人を超えまし

GRRM17 の AFIR は、非常に強力な化学反応経路の探索手法です。 GRRM は非常に便利なプログラムではあるのですが、出力ファイルをそのままでは GaussView では開くことができないという少し面倒な点があり

量子化学計算の出力ファイルには、たくさんの座標情報が含まれています。効率よく計算を進めて行く上で、計算の途中経過を定期的にチェックすることはとても大切です。しかし、計算途中の出力ファイルを計算系からダウンロードして、

研究者であれば、誰でも論文を添付ファイルとしてメールで送ったり、受け取ったりした経験があるのではないでしょうか？ボスから新着文献が送られてくることもあれば、共同研究者に参考文献を送ることもあります。また、購読できる雑

前回の記事では、python スクリプトを用いてジャーナル website で文献を検索する方法について紹介しました。第２回目の本記事では、selenium を使ってジャーナル website からあるキーワードを含む

最近、遷移状態後の枝分かれ反応についての報告が増えてきました。当ウェブサイトでも、これまでも PTSB (Post transition state bifurcation) に関する論文をいくつか紹介してきました。参

【2019 年 11 月発表の最新のランキングは、こちらの記事を参照してください。】 2019 年 6 月のスパコンランキング TOP500 と GREEN500 が発表されました。今回は、とりわけニュースにするような