TOP500 は時代遅れ？ 代替ベンチマークとしてHPCG に注目！<Top500 News No.10>

イオン液体の DMSO 中での酸性度の計算

有機化学反応機構を考察する上で、pKa の値を知っておくことは非常に重要です。Evans や Bordwell などの pKa テーブルを使用している方も多いのではないでしょうか？しかし、pKa テーブルには載っていな

昨年、ある雑誌に論文を投稿しようとしましたら、Word での template が存在せず LaTeX ファイルの template しかありませんでした。。。新しく創刊された Open access の雑誌などで特に

創薬研究において、低分子医薬品のタンパク質への結合様式の情報は非常に重要です。共結晶の取得が望ましいですが、結晶化が困難な場合も多いです。そのような場合に、威力を発揮するのがドッキングシミュレーションです。様々なド

多種多様な構造で我々を魅了してくれる天然物化合物。医薬品シードとしても有用なこれらの有機化合物の単離構造決定は世界中で盛んに行われています。しかし、その構造の複雑さ・特殊さから構造を決めることが困難な場合も多数あります

酸化酵素の中でも P450 は、多彩な反応を触媒するため多くの研究者の注目を集めています。P450 を用いたエンジニアリングも盛んに行われており、最近ではカルベノイドやナイトレノイドを発生することのできる P450 も報

DFT 計算での双極子モーメントの正確性に関するベンチマークがマーティン・ヘッドゴードン Martin Head-Gordon のグループから発表されました。 “How Accurate Is Densit

JCIM に計算化学分野での女性の割合が増えているという論文が出ていましたので、簡単に紹介したいと思います。ちなみに管理人がアメリカで所属していた研究室は 7 割くらいが女性でした。 “Computatio

今年の初め頃、David Sherman と Kendal Houk らのグループから hapalindole 生合成での Cope 転移を触媒する酵素 HpiC1 の計算化学も含めた酵素解析の論文が発表されま

励起状態でのプロトン移動（ESPT: Excited-State Proton Transfer ）は蛍光プローブや分子スイッチ、発光ダイオードなどの分子に関係していることから近年注目されている現象です。核酸塩基間でもこ

スーパーコンピューターのランキングとして有名な TOP500 ですが、もう時代遅れなのでは？と何年も前から言われています。最近では、より複雑な処理を行う HPCG というベンチマークが注目されています。参考：【TOP