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  • YouTube動画で、計算化学について学んでみました

    こんにちは。田中です。 私は、計算化学やシミュレーションに関しては、全くの初心者(素人)です。そんな私が、これから計算化学を学んでいくわけですが、「素人が計算化学を学んで、何をどう理解していくのか?(そもそも、理解できる

  • インターネット記事で、計算化学について学んでみました

    こんにちは。田中です。 私は、計算化学やシミュレーションに関しては、全くの初心者(素人)です。そんな私が、これから計算化学を学んでいくわけですが、「素人が計算化学を学んで、何をどう理解していくのか?(そもそも、理解できる

  • ログイン機能を実装する。電子実験ノートを自作してみた!導入コストゼロ!(5/5)

    前回に引き続き、電子実験ノートの自作の記事です。 今回は、電子実験ノートにログイン機能を実装します。 特に、研究グループ全体で電子実験ノートをシェアする場合など、ログイン機能や権限の付与は非常に重要となってきます。 また

  • PHP でブラウザから job を投入する。電子実験ノートを自作してみた!導入コストゼロ!(4/5)

    前回に引き続き、電子実験ノートの自作の記事です。 今回は、電子実験ノートから計算機に job を投入し、同時にノートを作成する機能を実装していきます。 参考:電子実験ノートを自作してみた!導入コストゼロ!(1/5)参考:

  • CRUD を実装!電子実験ノートを自作してみた!導入コストゼロ!(3/5)

    前回の記事に続き、電子実験ノートの自作の記事です。 今回は、記述、閲覧、編集、削除などの、実験ノートに必要な基本的な機能を実装していきます。 これらの機能は Create, Read, Update, Delete の頭

  • リアルタイムで計算状況を表示するシステムの構築!【電子実験ノートを自作してみた!導入コストゼロ!】(2/5)

    本記事は、前回の記事(電子実験ノートを自作してみた!導入コストゼロ!(1/5))の続きになります。 今回は、リアルタイムで複数の計算機での job の実行状況を表示させるシステムの構築を行います。 初心者の方でも、PHP

  • 電子実験ノートを自作してみた!導入コストゼロ!(1/5)

    管理人の大学院時代は、実験ノートは紙が当たり前でしたが、最近では電子実験ノート(Electronic Lab Notebook; ELN) がだいぶ普及しているようです。 電子実験ノートには様々なメリットがあります。例え

  • 分枝型拡張ヘテロ開裂反応の理論解析!〜divergent extended heterolytic fragmentations〜

    開裂反応というと、Eshenmoser 開裂や Mehta 開裂や Risch 開裂などが挙げられます(下図)。 このような結合の開裂を伴う fragmentation 反応は、分子骨格を構築する際の鍵反応として、全合成

  • 読み取りにくい SI の座標を簡単表示【python で OCR】

    SI の書き方は、研究室によって様々です。 丁寧に計算座標を何ページにも渡って貼り付けてくれる人もいれば、計算の input ファイルと output ファイルを supplementary material にしてくれ

  • Gauss View をカスタマイズしよう!その2【NMR の referenceを追加】

    計算化学が非常に身近になった現在では、実験化学者も簡単なスペクトル計算を活用して研究を進めているのではないでしょうか? 例えば、NMR 計算は、計算コストが小さく、もっとも手軽な計算の一つです。 参考:NMR計算のアドバ

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Optalysys 社 光学テクノロジを使用した AI ブレークスルー

2018年3月27日 管理人 ニュース

近年話題の人工知能 (AI)。 以前の記事でも紹介しましたが、既に様々な場面で実社会でも利用されています。 その更なる飛躍のきっかけとなるかは分かりませんが、Optalysys 社が光コプロセッサを用いるテクノロジーを発

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TOP500 は時代遅れ? 代替ベンチマークとしてHPCG に注目!

2018年3月23日 管理人 一般的な話題

スーパーコンピューターのランキングとして有名な TOP500 ですが、もう時代遅れなのでは?と何年も前から言われています。 最近では、より複雑な処理を行う HPCG というベンチマークが注目されています。 参考:【TOP

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青森の六ヶ所核融合研究所が強力なスーパーコンピューターを配備!

2018年3月19日 管理人 ニュース

青森の六ヶ所核融合研究所が、核融合研究分野では世界でもっとも強力なスーパーコンピューター Cray XC50 を配備するそうです。 核融合は、もし実現すれば世界のエネルギー需要を 1000 年以上 –もし海洋

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BMK 半経験的汎関数

2018年3月16日 管理人 汎関数

Boese と Martin が 2004 年に開発した半経験的汎関数。Boese-Martin for Kinetics の頭文字をとって BMK と自分たちで命名しています (参考文献 1 )。

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原始地球上の非生物的条件下での核酸塩基の生成機構

2018年3月13日 管理人 ブログ, 一般的な話題

初めて地球上に生命が誕生したのは、約 40 億年前と考えられています。原始の地球には生命に必要な有機分子(アミノ酸,核酸塩基,糖,脂肪酸,炭化水素など)が豊富に存在していたと考えられています。ここからどのようにして生命が

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完全な脳シミュレーションへの道

2018年3月11日 管理人 ニュース

近年、研究開発が進んでいるエクサスケール・スーパーコンピューター! 実現した場合、完全な脳シミュレーションが可能になるかと思いきや、そのためにはソフトウェアのブレークスルーも必要なようです! 最近、エクサスケール・スーパ

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大統領予算、米国エクサスケールコンピューターに6億3,600万ドル!

2018年3月8日 管理人 ニュース

大統領予算というと日本ではメキシコとの国境に壁を作ることばかり報じられておりませんが、科学技術分野ではエクサスケールコンピューターに 6 億 3,600万ドル (約 672 億円) の予算がつきそうなことが話題となってお

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Google 72-Qubit チップによる量子超越性を目指す

2018年3月7日 管理人 ニュース

(トップ画像は、Google が発表した新量子プロセッサ “Bristlecone” 、こちらのページより転載しました。) Google から新量子プロセッサー Bristlecone が発表され

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Lenovo HPC サーバを新発売、ドイツのトップスーパーコンピュータに!

2018年3月5日 管理人 一般的な話題

Lenovo が HPC サーバを新発売するそうです。すでにドイツのトップスーパーコンピュータSuperMUC-NG に導入されることが決定しました。 TOP500 の NEWS 欄には、毎週スーパーコンピューターに関す

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IBM が V100 GPU をクラウドに導入

2018年3月4日 管理人 ニュース

NVIDIA が 昨年末に発表した最新 GPU である V100 を IBM がクラウドに導入したようです。 TOP500 の NEWS 欄には、毎週スーパーコンピューターに関する最新情報が報告されています。残念ながら、

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