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書籍で計算化学について学んでみました_No.8

こんにちは。田中です。私は、計算化学やシミュレーションに関しては、全くの初心者（素人）です。そんな私が、これから計算化学を学んでいくわけですが「素人が計算化学を学んで、何をどう理解していくのか？（そもそも、理解できるの
書籍で計算化学について学んでみました_No.7

こんにちは。田中です。私は、計算化学やシミュレーションに関しては、全くの初心者（素人）です。そんな私が、これから計算化学を学んでいくわけですが「素人が計算化学を学んで、何をどう理解していくのか？（そもそも、理解できるの
書籍で計算化学について学んでみました_No.6

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書籍で計算化学について学んでみました_No.5

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書籍で計算化学について学んでみました_No.4

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書籍で計算化学について学んでみました_No.3

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書籍で計算化学について学んでみました_No2

こんにちは。田中です。私は、計算化学やシミュレーションに関しては、全くの初心者（素人）です。そんな私が、これから計算化学を学んでいくわけですが、「素人が計算化学を学んで、何をどう理解していくのか？（そもそも、理解できる
書籍で計算化学について学んでみました_No.1

こんにちは。田中です。私は、計算化学やシミュレーションに関しては、全くの初心者（素人）です。そんな私が、これから計算化学を学んでいくわけですが、「素人が計算化学を学んで、何をどう理解していくのか？（そもそも、理解できる
YouTube動画で、計算化学について学んでみました

こんにちは。田中です。私は、計算化学やシミュレーションに関しては、全くの初心者（素人）です。そんな私が、これから計算化学を学んでいくわけですが、「素人が計算化学を学んで、何をどう理解していくのか？（そもそも、理解できる
インターネット記事で、計算化学について学んでみました

こんにちは。田中です。私は、計算化学やシミュレーションに関しては、全くの初心者（素人）です。そんな私が、これから計算化学を学んでいくわけですが、「素人が計算化学を学んで、何をどう理解していくのか？（そもそも、理解できる

もしも計算化学プログラム自体にミスがあったら、、、

2018年8月27日管理人ブログ, 一般的な話題

計算化学者は、Developper と User の大きく二つのグループに分けられると思います。計算化学 User の人には、実験化学者の人も多く、計算化学ソフトウェアをブラックボックス的な感じで使っている人も多く、具

イオン液体の DMSO 中での酸性度の計算

2018年8月8日管理人ブログ, 一般的な話題

有機化学反応機構を考察する上で、pKa の値を知っておくことは非常に重要です。Evans や Bordwell などの pKa テーブルを使用している方も多いのではないでしょうか？しかし、pKa テーブルには載っていな

Overleaf で論文作成！

2018年7月30日管理人ブログ, 一般的な話題

昨年、ある雑誌に論文を投稿しようとしましたら、Word での template が存在せず LaTeX ファイルの template しかありませんでした。。。新しく創刊された Open access の雑誌などで特に

AutoDock のスコアファンクションはどれくらい正確か？CASF-2013 ベンチマーク

2018年7月27日管理人一般的な話題

創薬研究において、低分子医薬品のタンパク質への結合様式の情報は非常に重要です。共結晶の取得が望ましいですが、結晶化が困難な場合も多いです。そのような場合に、威力を発揮するのがドッキングシミュレーションです。様々なド

32 コア Threadripper2、2018 年夏に発売予定【AMD】

2018年7月25日管理人ニュース

AMD から Threadripper 2 が発表されました。現在のところ 8 月 13 日に市場に投入予定と言われています。驚くべきは、そのコア数！ 32-core/64-thread の Ryzen Threadr

Top500 で大きな順位変動！日本は 5 位。Green 500 は上位独占、HPCG は 3 位後退。【2018年6月】

2018年6月26日管理人ニュース

2018 年 6 月のスパコンランキング TOP500 と GREEN500 が発表されました。スパコンの単純な計算性能を競う TOP500 では、今回大きな順位変動が起きました。アメリカのスパコンが新たに１位と３位にラ

計算化学を用いた天然物の構造訂正

2018年6月25日管理人ブログ, 一般的な話題

多種多様な構造で我々を魅了してくれる天然物化合物。医薬品シードとしても有用なこれらの有機化合物の単離構造決定は世界中で盛んに行われています。しかし、その構造の複雑さ・特殊さから構造を決めることが困難な場合も多数あります

Cavium 社が ThunderX2 ARM プロセッサーをリリース！

2018年6月7日管理人ニュース

Cavium は ThunderX2 プロセッサーを一般向けにリリースしました。ARM 搭載の第 1 世代高性能コンピューターに向けたものと思われます。 TOP500 の NEWS 欄には、毎週スーパーコンピューターに関

P450 の量子化学計算【Griseofulvin】

2018年6月6日管理人一般的な話題

酸化酵素の中でも P450 は、多彩な反応を触媒するため多くの研究者の注目を集めています。P450 を用いたエンジニアリングも盛んに行われており、最近ではカルベノイドやナイトレノイドを発生することのできる P450 も報

不正を犯した研究者のためのリハビリプログラム

2018年5月17日管理人ニュース

昨年、論文不正で非常に話題になった東京大学の渡邊嘉典元教授が、イギリスのクリック研究所で不正研究者のためのリハビリプログラムに参加し、復帰を目指しているようです。 Nature News に出ていましたので、簡単に意訳し