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投稿者: 管理人

もしも計算化学プログラム自体にミスがあったら、、、

2018年8月27日 管理人 ブログ, 一般的な話題

計算化学者は、Developper と User の大きく二つのグループに分けられると思います。 計算化学 User の人には、実験化学者の人も多く、計算化学ソフトウェアをブラックボックス的な感じで使っている人も多く、具

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イオン液体の DMSO 中での酸性度の計算

2018年8月8日 管理人 ブログ, 一般的な話題

有機化学反応機構を考察する上で、pKa の値を知っておくことは非常に重要です。Evans や Bordwell などの pKa テーブルを使用している方も多いのではないでしょうか? しかし、pKa テーブルには載っていな

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Overleaf で論文作成!

2018年7月30日 管理人 ブログ, 一般的な話題

昨年、ある雑誌に論文を投稿しようとしましたら、Word での template が存在せず LaTeX ファイルの template しかありませんでした。。。 新しく創刊された Open access の雑誌などで特に

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AutoDock のスコアファンクションはどれくらい正確か?CASF-2013 ベンチマーク

2018年7月27日 管理人 一般的な話題

創薬研究において、低分子医薬品のタンパク質への結合様式の情報は非常に重要です。 共結晶の取得が望ましいですが、結晶化が困難な場合も多いです。 そのような場合に、威力を発揮するのがドッキングシミュレーションです。 様々なド

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32 コア Threadripper2、2018 年夏に発売予定【AMD】

2018年7月25日 管理人 ニュース

AMD から Threadripper 2 が発表されました。現在のところ 8 月 13 日に市場に投入予定と言われています。 驚くべきは、そのコア数! 32-core/64-thread の Ryzen Threadr

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Top500 で大きな順位変動!日本は 5 位。Green 500 は上位独占、HPCG は 3 位後退。【2018年6月】

2018年6月26日 管理人 ニュース

2018 年 6 月のスパコンランキング TOP500 と GREEN500 が発表されました。スパコンの単純な計算性能を競う TOP500 では、今回大きな順位変動が起きました。アメリカのスパコンが新たに1位と3位にラ

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計算化学を用いた天然物の構造訂正

2018年6月25日 管理人 ブログ, 一般的な話題

多種多様な構造で我々を魅了してくれる天然物化合物。医薬品シードとしても有用なこれらの有機化合物の単離構造決定は世界中で盛んに行われています。 しかし、その構造の複雑さ・特殊さから構造を決めることが困難な場合も多数あります

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Cavium 社が ThunderX2 ARM プロセッサーをリリース!

2018年6月7日 管理人 ニュース

Cavium は ThunderX2 プロセッサーを一般向けにリリースしました。ARM 搭載の第 1 世代高性能コンピューターに向けたものと思われます。 TOP500 の NEWS 欄には、毎週スーパーコンピューターに関

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米エネルギー省が Exascale 地球シミュレーションシステムを公開

2018年5月14日 管理人 ニュース

4 年間の開発を経て、米国エネルギー省(DOE)は天候および他の地球システムの高分解能シミュレーションを実行するための計算プラットフォームである Energy Exascale Earth System Model(E3

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富士通が理研の AI スーパーコンピューターをアップグレード

2018年5月10日 管理人 ニュース

富士通は、最新の V100 Tesla GPU を搭載した NVIDIA DGX-1 サーバで理研の RAIDEN スーパーコンピュータを大幅にアップグレードしました。 TOP500 の NEWS 欄には、毎週スーパーコ

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